フィリピン航空は2018年10月29日(月)から、マニラ/ニューヨーク・JFK線のうち、マニラ発PR126便はターミナル2、マニラ着PR127便はターミナル1を利用する運用に変更すると発表しました。現在、出発、到着ともにPR126、PR127便はターミナル1を利用していますが、出発便のみ変更されます。
現在、ターミナル1を利用する国際線はアブダビ、ダンマン、ドーハ、リヤド、トロント、バンクーバー線で、これらの路線は引き続きターミナル1を利用します。
なお、羽田、成田、関西、名古屋、新千歳、福岡線などの日本路線は全てターミナル2を利用しており、乗り継ぎで利用する場合は、出発時は便利になります。詳しい路線別の利用ターミナルについては、フィリピン航空のウェブサイトを参照ください。