スカイマークは2014年3月30日から、羽田/熊本線を運休する計画です。発表している3月30日から5月31日のスケジュールでは運航計画のスケジュールを記載していません。また、ウェブサイトでの予約も停止しています。
スカイマークの羽田/熊本線は2010年10月31日から運航、搭乗率は2011年度は80％、2012年度は75.7％、2013年度は4月から11月まで72.2％です。
羽田発着のスカイマーク運航路線の2013年度の搭乗率は11月までの数値は新千歳線の83.9％を筆頭に、福岡線82.5％、那覇線77.0％、神戸線76.8％、鹿児島線68.1%、旭川線が61.8％となっています。
なお、スカイマークは2010年10月に就航した神戸/熊本線を2012年10月に運休。当時は2012年5月に航空局からの厳重注意を受け、搭乗率の悪い路線からの撤退により安全運航のため予備機確保が大きな理由でした。