宮古空港は2016年12月28日(水)、これまでの有料待合室を改修し、出発待合室として使用を開始しました。これは同空港を利用する旅客数の増加に伴い、出発待合室が狭隘となっていることに対応する措置で、手荷物検査場を抜けてすぐの場所に設けられていましたが、新たにこの場所も待合室として利用できる様になっています。
宮古空港のターミナルビルは、吹き抜けを多様し、1階にも自然光が入り込むような造りが採用されています。1階には、チェックインカウンターと到着ロビー、2階に出発ロビーと郷土料理店やお土産品を取り揃えたショッピングモールが配置されています。