熊本空港とJR肥後大津駅(阿蘇熊本空港駅)を約15分で結ぶ「阿蘇くまもと空港ライナー」は、2019年3月31日(日)以降も現行ダイヤで運行を継続します。この空港ライナーは、1日54便が運行されており、予約不要で乗車でき、運賃は無料です。
JR肥後大津駅発の始発は6時20分、最終は19時35分、熊本空港発の始発は8時30分、最終は21時35分で、概ね30分に1本、運行されています。
2017年度から本格運行しており、利用者の利便性向上や利用者の増加につながる工夫などに取り組みながら、運行しています。なお、阿蘇くまもと空港ライナーのホームページでは、空港ライナー運行時刻にあうフライトの発着時刻も時刻表に記載されています。