エストニアン・エアは2012年10月末からのスケジュールで、ヨーテボリ線の新設、他の路線で増便を行う予定です。タリン/ヨーテボリ線は2013年2月1日に開設。運航は月、水、金、日の週4便を運航します。
タリン発着では、ストックホルム線で週27便、ヴィリニュス線が週25便、オスロ線は週13便、アムステルダム線は週14便、ブリュッセル線は週11便、モスクワ・シェレメーチエヴォ線は週15便、サンクトペテルブルグ線は週19便に、それぞれ増便します。
なお、季節便で運航しているカヤーニ、トビリシ、ハノーファー、ニース、ヴェネツィアの路線は予定通り終了し、2013年夏スケジュールで改めて運航を予定しています。
また、エストニアン・エアでは、座席数112席のERJ-190型をリースで導入を進めますが、これにあわせロンドン線を一時、運休します。2012年10月15日の運航を最後に、2013年に再開を予定しています。