エストニアン・エアは2012年10月1日から、荷物と機内食のサービスによって異なる運賃体系を導入します。搭乗するときに必要なサービスを選ぶスタイルがヨーロッパに広がっていることから、こうしたサービス変更を行うとしています。
あわせて、機内食のメニューも拡充。作り立てのサンドイッチのほか、暖かい食事、スナックなどを選ぶことができます。この機内食サービスは搭乗の36時間前に決める必要があります。
ビジネスクラスでも荷物と食事が含まれたタイプと、これに加えてラウンジ、ファストトラックの利用が含まれている運賃とが用意されています。