チェコ航空は2013年6月25日から、携帯電話を利用したモバイル・チェックインサービスを開始しました。このサービスはチェコ語をはじめ、英語、ロシア語、フランス語で提供しています。対応する空港もプラハをはじめ15空港でスタート、2013年から2014年にかけて対応する空港も拡大します。
このサービスの対応空港はプラハのルズィニエ国際空港、アブダビ、ベルリン、プラベスト、デュッセルドルフ、フランクフルト、ハンブルク、コシツェ、ミュンヘン、ニース、オデッサ、パリ、ローマ、仁川、ストックホルム、ストラスブールです。近く、アムステルダム、ブカレスト、コペンハーゲン、テルアビブ、ワルシャワ、チューリッヒにも対応します。
チェックインはスマートフォン、タブレットに対応しており、出発の30時間前から60分前までの手続きが可能で、長距離路線の場合は90分前までの手続きとなっています。
なお、仁川国際空港など、一部空港ではモバイルチェックイン後、携帯電話を使った搭乗に対応をしていない空港もあるため注意が必要です。詳しくはチェコ航空のウェブサイトを参照ください。