JALマイレージバンク(JMB)は2013年10月9日搭乗分から、ジェットスター・ジャパンの搭乗でマイル獲得が可能になることを告知しています。
マイル獲得できるのは、ジェットスター・ジャパンのPlusオプション選択とMaxオプション選択で搭乗した場合で、いずれも25%を獲得できます。最安の運賃となるStarter基本運賃ではマイルは獲得できません。
JALは2013年3月6日から、JMB会員を対象に、獲得したマイルをジェットスター・ジャパン運航便の特典航空券に交換するサービスがあるほか、国際線との接続でコードシェアを行っています。