2011年3月11日に発生した東日本大震災に関連し、地震、津波被害の中心地に近い山形県・庄内空港でも一部、混乱があった。ただし、3月12日の午前から同空港では羽田便の運航を開始している。この状況について、庄内空港ビルの公式ブログ「庄内まるかじりニコニコブログ」でレポートしている。
同ブログによると、空港ビル内に大きな損傷無かったものの、東北地方の停電などにより自家発電で空港ビルの営業を継続。3月11日は羽田便が欠航となったものの、3月12日は第1便から運航を再開。ビルの電力供給も12日午後3時には回復したという。