スターフライヤーは2016年6月20日(月)、4月に発生した熊本・大分地震に伴う義援金、総額7,372,925円を北九州市を通じ、社会福祉法人中央共同募金会へ寄贈しました。この内訳は、義援マイルが6,186,000円、スターフライヤーからの義援金が1,000,000円、同社役職員からの義援金が186,925円となっています。
スターフライヤーは、同社のマイレージプログラム「スターリンク」会員へマイルの寄付を2016年4月25日(月)から5月31(火)まで受付、500マイルを1口として募集し、1マイル1円相当として寄付しています。