JALホテルズは2012年4月1日から、日本国内のJALホテルズで電子マネー「WAON」を利用した支払いが可能になりました。このため、JMB WAONカード、JMB WAON一体型イオンJMBカード、モバイルJMB WAONで滞在中の支払いを済ませると、200円あたり1マイルを獲得できます。
JALホテルズはWAONの取扱いを記念して、4月1日から6月30日まで、「WAONで泊まっても！食べても！おトクキャンペーン」を開催しています。キャンペーンでは3,000円を1口に毎月抽選で30名にJMB WAON会員にJMB2,000マイル、WAON会員に2,000ワオンポイントをプレゼントします。
なお、ホテルJALシティ広島はWAONでの支払いの対象外。また、グループホテルのオークラホテルズ&リゾーツも対象外です。詳しくはJALホテルズのウェブサイトを参照ください。